LNG-1100 • Préparation pour le cours

Méthodes expérimentales et analyse de données

L’installation de R et RStudio + l’organisation de nos fichiers

L’installation de R + RStudio

Cliquez ici pour installer R et RStudio. Il faut installer R avant d’installer RStudio. Si vous utilisez un Mac, il faut s’assurer que vous avez complété correctement l’installation.

Après avoir installé les deux, ouvrez RStudio pour installer l’extension tidyverse : tapez install.packages("tidyverse") dans la console et appuyez sur entrée. Consultez les matériels sur monPortail et lisez le chapitre 6 de Barnier (2023) ici pour plus des détails.

L’organisation de vos fichiers

Dans ce cours, vous devez être capable d’organiser vos fichiers et de les localiser rapidement. En plus, ce n’est jamais une bonne idée de placer nos fichiers dans notre bureau. On utilisera la structure ci-dessous :

Créez un dossier pour le cours : LNG-1100 (c’est notre répertoire racine)
Créez deux sous-dossiers à l’intérieur de ce dossier : Donnees et Seances
Dans le dossier Seances, créez un dossier pour chaque séance : LNG-1100-2, LNG-1100-3, etc.
Créez un projet R dans le dossier LNG-1100 (consultez la fin de cette page)

Chaque fois que vous téléchargez un fichier de données de monPortail, vous devez le placer dans le dossier Donnees. Dans le diagramme ci-dessus, il y a trois fichiers csv dans le dossier en question. Ce sont les premiers fichiers qui seront explorés dans le cours. Chaque fois que vous créez un script (.R), vous devez le placer dans le dossier de la séance où on explore le script en question.

Voici une démonstration de la création de dossiers et de sous-dossiers. J’utilise le système d’exploitation Mac, mais la séquence d’étape est virtuellement identique pour ceux qui utilisent Windows.

C’est une bonne idée d’ajouter le dossier du cours à la barre latéral du Finder :

Notre projet R

On va utiliser un type de fichier appelé RProj pour notre cours. C’est le fichier sur lequel vous devez cliquez chaque fois que vous travaillez avec RStudio dans le cours. Ouvrez RStudio et suivez la démonstration ci-dessous pour créer le fichier RProj. Vous pouvez également cliquer sur File > New Project. On va créer notre projet dans le dossier LNG-1100 créé ci-dessus : cela sera notre répertoire de travail.

Questions?

Vous devez vous assurer que vous avez exactement la structure des fichiers et des dossiers dans la figure ci-dessous. Cela nous permettra de trouver nos fichiers rapidement pendant le semestre. Si vous avez des questions ou des problèmes, envoyez-moi un courrier ou consultez mes disponibilités pour prendre rendez-vous.

Les références

Barnier, J. (2023). Introduction à R et au tidyverse.